Il Presepe subacqueo nasce nel 1964, per iniziativa di alcuni abitanti della costiera, che vollero così ricordare i loro cari deceduti in mare. Le prime statue furono donate dall'importante ceramista Matteo Di Lieto. Queste vennero sostituite una prima volta nel 1987 con statue realizzate da Mario Di Lieto, figlio di Matteo. In seguito, nel 1992 le statue vennero realizzate in vetroresina, materiale più resistente agli agenti atmosferici e alla corrosione della salsedine. Tempo permettendo, ogni anno durante il periodo natalizio la grotta assiste al pellegrinaggio dei sub italiani: almeno 150 professionisti provenienti da ogni angolo del Paese si radunano per una processione di 16 metri nella galleria ricavata sott'acqua, rendendo omaggio al presepe e deponendo fasci di fiori ai piedi della statuetta di Gesù Bambino, non prima che il vescovo di Amalfi abbia celebrato la Santa Messa nel piazzale antistante alla grotta, in memoria di tutti i militari e i pescatori caduti in mare. Da tale tradizione, lungo la S.S. 163, negli ultimi decenni, si sono allestiti presepi permanenti da ammirare tutto l'anno e, durante il periodo natalizio, viene sono apposto il Bambino Gesù.
